Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CartptP56388 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CartptP56388 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CartptP56388 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CartptP56388 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CartptP56388 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CartptP56388 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CartptP56388 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CartptP56388 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CartptP56388 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CartptP56388 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CartptP56388 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CartptP56388 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CartptP56388 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CartptP56388 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CartptP56388 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CartptP56388 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CartptP56388 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CartptP56388 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CartptP56388 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CartptP56388 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CartptP56388 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CartptP56388 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CartptP56388 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CartptP56388 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CartptP56388 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CartptP56388 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CartptP56388 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CartptP56388 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CartptP56388 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CartptP56388 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CartptP56388 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CartptP56388 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CartptP56388 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CartptP56388 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CartptP56388 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CartptP56388 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CartptP56388 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CartptP56388 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CartptP56388 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CartptP56388 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CartptP56388 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CartptP56388 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CartptP56388 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CartptP56388 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CartptP56388 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CartptP56388 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CartptP56388 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CartptP56388 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CartptP56388 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CartptP56388 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CartptP56388 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CartptP56388 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CartptP56388 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CartptP56388 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CartptP56388 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CartptP56388 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CartptP56388 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CartptP56388 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CartptP56388 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CartptP56388 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CartptP56388 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CartptP56388 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CartptP56388 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CartptP56388 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CartptP56388 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CartptP56388 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CartptP56388 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CartptP56388 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CartptP56388 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CartptP56388 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CartptP56388 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CartptP56388 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CartptP56388 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CartptP56388 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CartptP56388 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CartptP56388 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CartptP56388 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CartptP56388 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CartptP56388 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CartptP56388 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CartptP56388 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CartptP56388 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CartptP56388 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CartptP56388 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CartptP56388 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CartptP56388 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CartptP56388 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CartptP56388 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CartptP56388 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CartptP56388 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CartptP56388 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CartptP56388 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CartptP56388 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CartptP56388 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CartptP56388 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CartptP56388 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CartptP56388 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CartptP56388 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CartptP56388 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms