Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAG2P55895 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAG2P55895 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAG2P55895 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAG2P55895 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAG2P55895 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAG2P55895 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAG2P55895 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAG2P55895 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAG2P55895 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAG2P55895 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAG2P55895 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAG2P55895 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAG2P55895 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAG2P55895 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAG2P55895 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAG2P55895 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAG2P55895 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAG2P55895 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAG2P55895 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAG2P55895 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAG2P55895 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAG2P55895 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAG2P55895 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAG2P55895 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAG2P55895 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAG2P55895 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAG2P55895 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAG2P55895 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAG2P55895 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAG2P55895 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAG2P55895 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAG2P55895 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAG2P55895 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAG2P55895 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAG2P55895 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAG2P55895 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAG2P55895 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAG2P55895 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAG2P55895 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAG2P55895 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAG2P55895 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAG2P55895 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAG2P55895 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAG2P55895 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAG2P55895 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAG2P55895 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAG2P55895 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAG2P55895 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAG2P55895 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAG2P55895 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAG2P55895 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAG2P55895 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAG2P55895 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAG2P55895 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAG2P55895 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAG2P55895 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAG2P55895 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAG2P55895 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAG2P55895 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAG2P55895 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAG2P55895 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAG2P55895 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAG2P55895 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAG2P55895 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAG2P55895 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAG2P55895 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAG2P55895 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAG2P55895 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAG2P55895 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAG2P55895 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAG2P55895 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAG2P55895 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAG2P55895 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAG2P55895 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAG2P55895 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAG2P55895 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAG2P55895 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAG2P55895 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAG2P55895 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAG2P55895 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAG2P55895 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAG2P55895 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAG2P55895 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAG2P55895 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAG2P55895 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAG2P55895 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAG2P55895 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAG2P55895 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAG2P55895 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAG2P55895 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAG2P55895 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAG2P55895 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAG2P55895 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAG2P55895 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAG2P55895 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAG2P55895 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAG2P55895 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAG2P55895 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAG2P55895 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms