Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRP55822 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3BGRP55822 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms