Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh5P55284 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh5P55284 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh5P55284 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh5P55284 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh5P55284 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh5P55284 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh5P55284 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh5P55284 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh5P55284 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh5P55284 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh5P55284 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms