Protein–RNA interactions for Protein: P55283

CDH4, Cadherin-4, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH4P55283 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH4P55283 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH4P55283 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH4P55283 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH4P55283 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH4P55283 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH4P55283 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH4P55283 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH4P55283 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH4P55283 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH4P55283 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH4P55283 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH4P55283 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH4P55283 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH4P55283 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH4P55283 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH4P55283 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH4P55283 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH4P55283 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH4P55283 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH4P55283 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH4P55283 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH4P55283 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH4P55283 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH4P55283 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH4P55283 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH4P55283 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH4P55283 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH4P55283 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH4P55283 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH4P55283 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH4P55283 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH4P55283 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH4P55283 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH4P55283 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH4P55283 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH4P55283 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH4P55283 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH4P55283 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH4P55283 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH4P55283 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH4P55283 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH4P55283 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH4P55283 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH4P55283 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH4P55283 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH4P55283 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH4P55283 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH4P55283 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH4P55283 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH4P55283 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH4P55283 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH4P55283 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH4P55283 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH4P55283 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH4P55283 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH4P55283 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH4P55283 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH4P55283 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH4P55283 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH4P55283 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH4P55283 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH4P55283 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH4P55283 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH4P55283 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH4P55283 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH4P55283 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH4P55283 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CDH4P55283 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH4P55283 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH4P55283 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH4P55283 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH4P55283 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH4P55283 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH4P55283 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH4P55283 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH4P55283 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH4P55283 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH4P55283 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH4P55283 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH4P55283 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH4P55283 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH4P55283 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH4P55283 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH4P55283 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH4P55283 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH4P55283 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH4P55283 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH4P55283 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH4P55283 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH4P55283 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH4P55283 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH4P55283 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH4P55283 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH4P55283 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH4P55283 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH4P55283 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH4P55283 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH4P55283 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH4P55283 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms