Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
AFDNP55196 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
AFDNP55196 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
AFDNP55196 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
AFDNP55196 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
AFDNP55196 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
AFDNP55196 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
AFDNP55196 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
AFDNP55196 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
AFDNP55196 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
AFDNP55196 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
AFDNP55196 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
AFDNP55196 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
AFDNP55196 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
AFDNP55196 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
AFDNP55196 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
AFDNP55196 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
AFDNP55196 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
AFDNP55196 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
AFDNP55196 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
AFDNP55196 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
AFDNP55196 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
AFDNP55196 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
AFDNP55196 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
AFDNP55196 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
AFDNP55196 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
AFDNP55196 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
AFDNP55196 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
AFDNP55196 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
AFDNP55196 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
AFDNP55196 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
AFDNP55196 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
AFDNP55196 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
AFDNP55196 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
AFDNP55196 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
AFDNP55196 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
AFDNP55196 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
AFDNP55196 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
AFDNP55196 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
AFDNP55196 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
AFDNP55196 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
AFDNP55196 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
AFDNP55196 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
AFDNP55196 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
AFDNP55196 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
AFDNP55196 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
AFDNP55196 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
AFDNP55196 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
AFDNP55196 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
AFDNP55196 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
AFDNP55196 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
AFDNP55196 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
AFDNP55196 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
AFDNP55196 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
AFDNP55196 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
AFDNP55196 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
AFDNP55196 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
AFDNP55196 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
AFDNP55196 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
AFDNP55196 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
AFDNP55196 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
AFDNP55196 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
AFDNP55196 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
AFDNP55196 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
AFDNP55196 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
AFDNP55196 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
AFDNP55196 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
AFDNP55196 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
AFDNP55196 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
AFDNP55196 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
AFDNP55196 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
AFDNP55196 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
AFDNP55196 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
AFDNP55196 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
AFDNP55196 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
AFDNP55196 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
AFDNP55196 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
AFDNP55196 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
AFDNP55196 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
AFDNP55196 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
AFDNP55196 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
AFDNP55196 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
AFDNP55196 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
AFDNP55196 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
AFDNP55196 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
AFDNP55196 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
AFDNP55196 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
AFDNP55196 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
AFDNP55196 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
AFDNP55196 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
AFDNP55196 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
AFDNP55196 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
AFDNP55196 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
AFDNP55196 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
AFDNP55196 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
AFDNP55196 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
AFDNP55196 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
AFDNP55196 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
AFDNP55196 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
AFDNP55196 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms