Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDF10P55107 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDF10P55107 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDF10P55107 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF10P55107 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF10P55107 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF10P55107 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF10P55107 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF10P55107 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF10P55107 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF10P55107 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF10P55107 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF10P55107 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF10P55107 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF10P55107 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF10P55107 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF10P55107 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF10P55107 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF10P55107 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF10P55107 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF10P55107 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF10P55107 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF10P55107 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF10P55107 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF10P55107 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF10P55107 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF10P55107 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF10P55107 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF10P55107 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF10P55107 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF10P55107 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF10P55107 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF10P55107 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF10P55107 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF10P55107 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF10P55107 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF10P55107 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF10P55107 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF10P55107 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF10P55107 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF10P55107 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF10P55107 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF10P55107 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF10P55107 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF10P55107 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF10P55107 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF10P55107 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF10P55107 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF10P55107 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF10P55107 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF10P55107 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF10P55107 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF10P55107 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF10P55107 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF10P55107 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF10P55107 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF10P55107 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF10P55107 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF10P55107 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF10P55107 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF10P55107 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF10P55107 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GDF10P55107 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GDF10P55107 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF10P55107 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF10P55107 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF10P55107 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF10P55107 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF10P55107 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF10P55107 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF10P55107 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDF10P55107 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GDF10P55107 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDF10P55107 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF10P55107 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF10P55107 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF10P55107 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF10P55107 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF10P55107 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF10P55107 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF10P55107 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF10P55107 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF10P55107 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF10P55107 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDF10P55107 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDF10P55107 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDF10P55107 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDF10P55107 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GDF10P55107 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF10P55107 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF10P55107 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF10P55107 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF10P55107 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF10P55107 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF10P55107 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF10P55107 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF10P55107 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GDF10P55107 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF10P55107 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF10P55107 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms