Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PltpP55065 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PltpP55065 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PltpP55065 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PltpP55065 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PltpP55065 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PltpP55065 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PltpP55065 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PltpP55065 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PltpP55065 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PltpP55065 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PltpP55065 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PltpP55065 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PltpP55065 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PltpP55065 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PltpP55065 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PltpP55065 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PltpP55065 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PltpP55065 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PltpP55065 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PltpP55065 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PltpP55065 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PltpP55065 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PltpP55065 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PltpP55065 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PltpP55065 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PltpP55065 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PltpP55065 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PltpP55065 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PltpP55065 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PltpP55065 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PltpP55065 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PltpP55065 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PltpP55065 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PltpP55065 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PltpP55065 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PltpP55065 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PltpP55065 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PltpP55065 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PltpP55065 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PltpP55065 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PltpP55065 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PltpP55065 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PltpP55065 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PltpP55065 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PltpP55065 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PltpP55065 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PltpP55065 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PltpP55065 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PltpP55065 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PltpP55065 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PltpP55065 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PltpP55065 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PltpP55065 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PltpP55065 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PltpP55065 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PltpP55065 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PltpP55065 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PltpP55065 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PltpP55065 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PltpP55065 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PltpP55065 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PltpP55065 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PltpP55065 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PltpP55065 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PltpP55065 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PltpP55065 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PltpP55065 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PltpP55065 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PltpP55065 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PltpP55065 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PltpP55065 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PltpP55065 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PltpP55065 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PltpP55065 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PltpP55065 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PltpP55065 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PltpP55065 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PltpP55065 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PltpP55065 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PltpP55065 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PltpP55065 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PltpP55065 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PltpP55065 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PltpP55065 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PltpP55065 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PltpP55065 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PltpP55065 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PltpP55065 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PltpP55065 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PltpP55065 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PltpP55065 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PltpP55065 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PltpP55065 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PltpP55065 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PltpP55065 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PltpP55065 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PltpP55065 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PltpP55065 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PltpP55065 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms