Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4P55056 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4P55056 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4P55056 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4P55056 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4P55056 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4P55056 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4P55056 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4P55056 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4P55056 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4P55056 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4P55056 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4P55056 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4P55056 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4P55056 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4P55056 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4P55056 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4P55056 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4P55056 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4P55056 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4P55056 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4P55056 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4P55056 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4P55056 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4P55056 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4P55056 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4P55056 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4P55056 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4P55056 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4P55056 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4P55056 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4P55056 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC4P55056 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4P55056 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4P55056 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4P55056 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4P55056 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC4P55056 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4P55056 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4P55056 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4P55056 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4P55056 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4P55056 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4P55056 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4P55056 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4P55056 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4P55056 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4P55056 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4P55056 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4P55056 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4P55056 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4P55056 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4P55056 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4P55056 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4P55056 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4P55056 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOC4P55056 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4P55056 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4P55056 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4P55056 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4P55056 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4P55056 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4P55056 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4P55056 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4P55056 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4P55056 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4P55056 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4P55056 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC4P55056 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4P55056 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4P55056 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4P55056 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4P55056 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC4P55056 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4P55056 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4P55056 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4P55056 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4P55056 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4P55056 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4P55056 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4P55056 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4P55056 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4P55056 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4P55056 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4P55056 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4P55056 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4P55056 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4P55056 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4P55056 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4P55056 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4P55056 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4P55056 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4P55056 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4P55056 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4P55056 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4P55056 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4P55056 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4P55056 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4P55056 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOC4P55056 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms