Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATN1P54259 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATN1P54259 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATN1P54259 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATN1P54259 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATN1P54259 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATN1P54259 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATN1P54259 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATN1P54259 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATN1P54259 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATN1P54259 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATN1P54259 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATN1P54259 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATN1P54259 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATN1P54259 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATN1P54259 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ATN1P54259 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATN1P54259 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ATN1P54259 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATN1P54259 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATN1P54259 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATN1P54259 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATN1P54259 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ATN1P54259 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATN1P54259 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATN1P54259 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATN1P54259 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATN1P54259 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATN1P54259 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATN1P54259 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATN1P54259 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ATN1P54259 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATN1P54259 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATN1P54259 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATN1P54259 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATN1P54259 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATN1P54259 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATN1P54259 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATN1P54259 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATN1P54259 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATN1P54259 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATN1P54259 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATN1P54259 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATN1P54259 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATN1P54259 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATN1P54259 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATN1P54259 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATN1P54259 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATN1P54259 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATN1P54259 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATN1P54259 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATN1P54259 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATN1P54259 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATN1P54259 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATN1P54259 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATN1P54259 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATN1P54259 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATN1P54259 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATN1P54259 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATN1P54259 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATN1P54259 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATN1P54259 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATN1P54259 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATN1P54259 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATN1P54259 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATN1P54259 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATN1P54259 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATN1P54259 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATN1P54259 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATN1P54259 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATN1P54259 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATN1P54259 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATN1P54259 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATN1P54259 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATN1P54259 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATN1P54259 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATN1P54259 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATN1P54259 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATN1P54259 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATN1P54259 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATN1P54259 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATN1P54259 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATN1P54259 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATN1P54259 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATN1P54259 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATN1P54259 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATN1P54259 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATN1P54259 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATN1P54259 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATN1P54259 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATN1P54259 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATN1P54259 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATN1P54259 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATN1P54259 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATN1P54259 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATN1P54259 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATN1P54259 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATN1P54259 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATN1P54259 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATN1P54259 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms