Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRISP3P54108 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRISP3P54108 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRISP3P54108 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms