Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLNS1AP54105 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLNS1AP54105 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms