Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SUCLG1P53597 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG1P53597 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLG1P53597 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms