Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX2-5P52952 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NKX2-5P52952 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms