Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX2P52951 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX2P52951 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX2P52951 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX2P52951 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBX2P52951 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBX2P52951 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBX2P52951 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBX2P52951 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBX2P52951 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBX2P52951 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX2P52951 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX2P52951 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX2P52951 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX2P52951 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX2P52951 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX2P52951 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX2P52951 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX2P52951 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GBX2P52951 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBX2P52951 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBX2P52951 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBX2P52951 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBX2P52951 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX2P52951 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX2P52951 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX2P52951 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX2P52951 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX2P52951 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GBX2P52951 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBX2P52951 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBX2P52951 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX2P52951 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX2P52951 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX2P52951 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX2P52951 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX2P52951 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX2P52951 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBX2P52951 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX2P52951 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX2P52951 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX2P52951 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX2P52951 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX2P52951 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBX2P52951 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX2P52951 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX2P52951 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX2P52951 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBX2P52951 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GBX2P52951 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBX2P52951 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBX2P52951 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX2P52951 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX2P52951 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBX2P52951 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBX2P52951 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBX2P52951 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GBX2P52951 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBX2P52951 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBX2P52951 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX2P52951 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX2P52951 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX2P52951 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX2P52951 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX2P52951 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX2P52951 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX2P52951 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX2P52951 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBX2P52951 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX2P52951 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX2P52951 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX2P52951 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX2P52951 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX2P52951 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX2P52951 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBX2P52951 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX2P52951 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX2P52951 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX2P52951 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX2P52951 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX2P52951 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX2P52951 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX2P52951 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBX2P52951 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBX2P52951 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBX2P52951 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBX2P52951 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBX2P52951 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBX2P52951 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBX2P52951 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX2P52951 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX2P52951 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX2P52951 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX2P52951 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX2P52951 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX2P52951 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX2P52951 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBX2P52951 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX2P52951 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX2P52951 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.9 ms