Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDR1P51861 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDR1P51861 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDR1P51861 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDR1P51861 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDR1P51861 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDR1P51861 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDR1P51861 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDR1P51861 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDR1P51861 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDR1P51861 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDR1P51861 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDR1P51861 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDR1P51861 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDR1P51861 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDR1P51861 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDR1P51861 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDR1P51861 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDR1P51861 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDR1P51861 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDR1P51861 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDR1P51861 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDR1P51861 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDR1P51861 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDR1P51861 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDR1P51861 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDR1P51861 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDR1P51861 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDR1P51861 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDR1P51861 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDR1P51861 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDR1P51861 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR1P51861 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR1P51861 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR1P51861 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR1P51861 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR1P51861 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR1P51861 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDR1P51861 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDR1P51861 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR1P51861 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR1P51861 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR1P51861 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR1P51861 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDR1P51861 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDR1P51861 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDR1P51861 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDR1P51861 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDR1P51861 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDR1P51861 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDR1P51861 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDR1P51861 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR1P51861 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR1P51861 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR1P51861 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR1P51861 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR1P51861 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDR1P51861 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDR1P51861 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDR1P51861 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDR1P51861 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDR1P51861 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDR1P51861 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR1P51861 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR1P51861 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR1P51861 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR1P51861 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR1P51861 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDR1P51861 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms