Protein–RNA interactions for Protein: P51665

PSMD7, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD7P51665 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD7P51665 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD7P51665 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD7P51665 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD7P51665 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD7P51665 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD7P51665 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD7P51665 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD7P51665 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD7P51665 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD7P51665 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD7P51665 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms