Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRCA2P51587 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRCA2P51587 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRCA2P51587 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRCA2P51587 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms