Protein–RNA interactions for Protein: P51513

NOVA1, RNA-binding protein Nova-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOVA1P51513 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOVA1P51513 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOVA1P51513 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOVA1P51513 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NOVA1P51513 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOVA1P51513 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOVA1P51513 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOVA1P51513 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOVA1P51513 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOVA1P51513 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOVA1P51513 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOVA1P51513 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOVA1P51513 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOVA1P51513 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOVA1P51513 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms