Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RORCP51449 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RORCP51449 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RORCP51449 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RORCP51449 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RORCP51449 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RORCP51449 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RORCP51449 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORCP51449 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORCP51449 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORCP51449 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RORCP51449 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RORCP51449 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RORCP51449 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RORCP51449 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RORCP51449 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RORCP51449 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RORCP51449 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RORCP51449 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RORCP51449 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RORCP51449 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RORCP51449 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RORCP51449 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RORCP51449 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RORCP51449 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RORCP51449 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RORCP51449 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RORCP51449 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RORCP51449 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORCP51449 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORCP51449 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORCP51449 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORCP51449 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RORCP51449 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RORCP51449 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RORCP51449 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RORCP51449 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RORCP51449 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RORCP51449 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RORCP51449 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RORCP51449 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RORCP51449 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RORCP51449 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RORCP51449 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RORCP51449 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RORCP51449 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RORCP51449 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RORCP51449 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RORCP51449 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RORCP51449 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RORCP51449 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RORCP51449 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RORCP51449 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RORCP51449 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RORCP51449 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RORCP51449 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RORCP51449 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RORCP51449 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RORCP51449 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORCP51449 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORCP51449 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORCP51449 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORCP51449 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORCP51449 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORCP51449 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORCP51449 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORCP51449 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORCP51449 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORCP51449 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORCP51449 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORCP51449 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORCP51449 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORCP51449 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RORCP51449 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RORCP51449 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RORCP51449 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RORCP51449 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RORCP51449 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RORCP51449 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RORCP51449 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RORCP51449 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RORCP51449 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORCP51449 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORCP51449 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORCP51449 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORCP51449 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORCP51449 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RORCP51449 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RORCP51449 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RORCP51449 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORCP51449 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORCP51449 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORCP51449 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORCP51449 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORCP51449 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORCP51449 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORCP51449 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RORCP51449 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORCP51449 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORCP51449 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms