Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB5CP51148 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB5CP51148 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB5CP51148 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB5CP51148 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB5CP51148 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB5CP51148 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB5CP51148 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB5CP51148 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB5CP51148 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB5CP51148 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB5CP51148 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB5CP51148 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms