Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pa2g4P50580 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pa2g4P50580 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pa2g4P50580 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pa2g4P50580 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pa2g4P50580 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Pa2g4P50580 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pa2g4P50580 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pa2g4P50580 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pa2g4P50580 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pa2g4P50580 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Pa2g4P50580 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pa2g4P50580 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pa2g4P50580 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Pa2g4P50580 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pa2g4P50580 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pa2g4P50580 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pa2g4P50580 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pa2g4P50580 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pa2g4P50580 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pa2g4P50580 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pa2g4P50580 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pa2g4P50580 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pa2g4P50580 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pa2g4P50580 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pa2g4P50580 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pa2g4P50580 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 833.6 ms