Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASCL1P50553 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASCL1P50553 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASCL1P50553 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASCL1P50553 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms