Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdi1P50396 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdi1P50396 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdi1P50396 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdi1P50396 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdi1P50396 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdi1P50396 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdi1P50396 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdi1P50396 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdi1P50396 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdi1P50396 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdi1P50396 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdi1P50396 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdi1P50396 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdi1P50396 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdi1P50396 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdi1P50396 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms