Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKN1CP49918 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN1CP49918 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN1CP49918 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms