Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psen1P49769 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psen1P49769 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psen1P49769 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Psen1P49769 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Psen1P49769 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Psen1P49769 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psen1P49769 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psen1P49769 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psen1P49769 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psen1P49769 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psen1P49769 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psen1P49769 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psen1P49769 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psen1P49769 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psen1P49769 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Psen1P49769 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psen1P49769 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psen1P49769 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psen1P49769 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psen1P49769 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psen1P49769 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psen1P49769 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psen1P49769 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psen1P49769 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psen1P49769 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psen1P49769 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psen1P49769 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psen1P49769 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms