Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CSNK1EP49674 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CSNK1EP49674 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSNK1EP49674 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSNK1EP49674 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSNK1EP49674 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms