Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRIM1P49642 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PRIM1P49642 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PRIM1P49642 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRIM1P49642 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRIM1P49642 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRIM1P49642 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRIM1P49642 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRIM1P49642 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRIM1P49642 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRIM1P49642 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRIM1P49642 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRIM1P49642 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRIM1P49642 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRIM1P49642 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRIM1P49642 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRIM1P49642 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PRIM1P49642 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRIM1P49642 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRIM1P49642 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms