Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNTAP49354 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNTAP49354 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNTAP49354 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNTAP49354 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNTAP49354 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FNTAP49354 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNTAP49354 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNTAP49354 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FNTAP49354 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FNTAP49354 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FNTAP49354 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FNTAP49354 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FNTAP49354 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FNTAP49354 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FNTAP49354 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FNTAP49354 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FNTAP49354 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FNTAP49354 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FNTAP49354 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FNTAP49354 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FNTAP49354 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FNTAP49354 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FNTAP49354 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FNTAP49354 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FNTAP49354 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FNTAP49354 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FNTAP49354 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FNTAP49354 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FNTAP49354 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FNTAP49354 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FNTAP49354 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FNTAP49354 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FNTAP49354 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FNTAP49354 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FNTAP49354 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FNTAP49354 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FNTAP49354 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNTAP49354 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNTAP49354 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNTAP49354 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNTAP49354 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNTAP49354 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNTAP49354 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FNTAP49354 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNTAP49354 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FNTAP49354 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FNTAP49354 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FNTAP49354 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FNTAP49354 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FNTAP49354 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FNTAP49354 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FNTAP49354 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FNTAP49354 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FNTAP49354 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FNTAP49354 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FNTAP49354 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FNTAP49354 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FNTAP49354 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNTAP49354 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNTAP49354 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNTAP49354 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNTAP49354 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNTAP49354 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNTAP49354 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNTAP49354 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNTAP49354 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FNTAP49354 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FNTAP49354 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FNTAP49354 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FNTAP49354 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FNTAP49354 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FNTAP49354 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FNTAP49354 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FNTAP49354 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FNTAP49354 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FNTAP49354 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FNTAP49354 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FNTAP49354 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FNTAP49354 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FNTAP49354 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FNTAP49354 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FNTAP49354 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FNTAP49354 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FNTAP49354 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FNTAP49354 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FNTAP49354 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FNTAP49354 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FNTAP49354 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FNTAP49354 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FNTAP49354 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FNTAP49354 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FNTAP49354 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FNTAP49354 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FNTAP49354 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNTAP49354 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNTAP49354 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNTAP49354 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNTAP49354 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNTAP49354 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms