Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc3P49135 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc3P49135 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc3P49135 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc3P49135 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc3P49135 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc3P49135 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ercc3P49135 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms