Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PXNP49023 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PXNP49023 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PXNP49023 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PXNP49023 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PXNP49023 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PXNP49023 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PXNP49023 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PXNP49023 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PXNP49023 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PXNP49023 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PXNP49023 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PXNP49023 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PXNP49023 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PXNP49023 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PXNP49023 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PXNP49023 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PXNP49023 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PXNP49023 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PXNP49023 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PXNP49023 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PXNP49023 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PXNP49023 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PXNP49023 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PXNP49023 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PXNP49023 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PXNP49023 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PXNP49023 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PXNP49023 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PXNP49023 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PXNP49023 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PXNP49023 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PXNP49023 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PXNP49023 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PXNP49023 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PXNP49023 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PXNP49023 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PXNP49023 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PXNP49023 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PXNP49023 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PXNP49023 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PXNP49023 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PXNP49023 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PXNP49023 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PXNP49023 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PXNP49023 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PXNP49023 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PXNP49023 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PXNP49023 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PXNP49023 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PXNP49023 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PXNP49023 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PXNP49023 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PXNP49023 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PXNP49023 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PXNP49023 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PXNP49023 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PXNP49023 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PXNP49023 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PXNP49023 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PXNP49023 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PXNP49023 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PXNP49023 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PXNP49023 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PXNP49023 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PXNP49023 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PXNP49023 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PXNP49023 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PXNP49023 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PXNP49023 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PXNP49023 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PXNP49023 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PXNP49023 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PXNP49023 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PXNP49023 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PXNP49023 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PXNP49023 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PXNP49023 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PXNP49023 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PXNP49023 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PXNP49023 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PXNP49023 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PXNP49023 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PXNP49023 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PXNP49023 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PXNP49023 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PXNP49023 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PXNP49023 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PXNP49023 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PXNP49023 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PXNP49023 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PXNP49023 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PXNP49023 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PXNP49023 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PXNP49023 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PXNP49023 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PXNP49023 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PXNP49023 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PXNP49023 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PXNP49023 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms