Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PcntP48725 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PcntP48725 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PcntP48725 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PcntP48725 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PcntP48725 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PcntP48725 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PcntP48725 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PcntP48725 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PcntP48725 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PcntP48725 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PcntP48725 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PcntP48725 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PcntP48725 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PcntP48725 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PcntP48725 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PcntP48725 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PcntP48725 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PcntP48725 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PcntP48725 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PcntP48725 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PcntP48725 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PcntP48725 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PcntP48725 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PcntP48725 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PcntP48725 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PcntP48725 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PcntP48725 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PcntP48725 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PcntP48725 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PcntP48725 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PcntP48725 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PcntP48725 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PcntP48725 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PcntP48725 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PcntP48725 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PcntP48725 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PcntP48725 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PcntP48725 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PcntP48725 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PcntP48725 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PcntP48725 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PcntP48725 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PcntP48725 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PcntP48725 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PcntP48725 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PcntP48725 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PcntP48725 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PcntP48725 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PcntP48725 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PcntP48725 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PcntP48725 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PcntP48725 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PcntP48725 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PcntP48725 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PcntP48725 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PcntP48725 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PcntP48725 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PcntP48725 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PcntP48725 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PcntP48725 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PcntP48725 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PcntP48725 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PcntP48725 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PcntP48725 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PcntP48725 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PcntP48725 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PcntP48725 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PcntP48725 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PcntP48725 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PcntP48725 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PcntP48725 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PcntP48725 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PcntP48725 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PcntP48725 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PcntP48725 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PcntP48725 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PcntP48725 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PcntP48725 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PcntP48725 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PcntP48725 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PcntP48725 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PcntP48725 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PcntP48725 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PcntP48725 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcntP48725 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcntP48725 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcntP48725 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcntP48725 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms