Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTDSS1P48651 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTDSS1P48651 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTDSS1P48651 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTDSS1P48651 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms