Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCT5P48643 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCT5P48643 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCT5P48643 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCT5P48643 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCT5P48643 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCT5P48643 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCT5P48643 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCT5P48643 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCT5P48643 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCT5P48643 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCT5P48643 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCT5P48643 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCT5P48643 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCT5P48643 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCT5P48643 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCT5P48643 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCT5P48643 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCT5P48643 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCT5P48643 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCT5P48643 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCT5P48643 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCT5P48643 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCT5P48643 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCT5P48643 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCT5P48643 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCT5P48643 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCT5P48643 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCT5P48643 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCT5P48643 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT5P48643 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT5P48643 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT5P48643 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT5P48643 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT5P48643 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT5P48643 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT5P48643 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT5P48643 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCT5P48643 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCT5P48643 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCT5P48643 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCT5P48643 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCT5P48643 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCT5P48643 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCT5P48643 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCT5P48643 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCT5P48643 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT5P48643 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT5P48643 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT5P48643 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT5P48643 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT5P48643 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT5P48643 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT5P48643 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT5P48643 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT5P48643 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCT5P48643 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCT5P48643 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCT5P48643 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCT5P48643 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCT5P48643 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT5P48643 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT5P48643 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT5P48643 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT5P48643 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT5P48643 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT5P48643 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT5P48643 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT5P48643 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT5P48643 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT5P48643 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT5P48643 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT5P48643 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT5P48643 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT5P48643 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT5P48643 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT5P48643 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT5P48643 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT5P48643 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT5P48643 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT5P48643 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT5P48643 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT5P48643 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT5P48643 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT5P48643 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT5P48643 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT5P48643 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCT5P48643 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCT5P48643 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCT5P48643 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT5P48643 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT5P48643 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT5P48643 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT5P48643 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT5P48643 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT5P48643 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCT5P48643 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCT5P48643 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCT5P48643 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCT5P48643 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268 ms