Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pax7P47239 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax7P47239 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax7P47239 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax7P47239 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pax7P47239 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax7P47239 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax7P47239 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax7P47239 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax7P47239 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax7P47239 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pax7P47239 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pax7P47239 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pax7P47239 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pax7P47239 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pax7P47239 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pax7P47239 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pax7P47239 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pax7P47239 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pax7P47239 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pax7P47239 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pax7P47239 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pax7P47239 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pax7P47239 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pax7P47239 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pax7P47239 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pax7P47239 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pax7P47239 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pax7P47239 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pax7P47239 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pax7P47239 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pax7P47239 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pax7P47239 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pax7P47239 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pax7P47239 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pax7P47239 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pax7P47239 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pax7P47239 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pax7P47239 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pax7P47239 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pax7P47239 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pax7P47239 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pax7P47239 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pax7P47239 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax7P47239 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms