Protein–RNA interactions for Protein: P47212

Gal, Galanin peptides, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GalP47212 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GalP47212 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GalP47212 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GalP47212 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GalP47212 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GalP47212 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GalP47212 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GalP47212 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GalP47212 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GalP47212 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GalP47212 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GalP47212 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GalP47212 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GalP47212 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GalP47212 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GalP47212 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GalP47212 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GalP47212 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GalP47212 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GalP47212 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GalP47212 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GalP47212 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GalP47212 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GalP47212 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GalP47212 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GalP47212 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GalP47212 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GalP47212 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GalP47212 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GalP47212 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GalP47212 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GalP47212 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GalP47212 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GalP47212 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GalP47212 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GalP47212 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GalP47212 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GalP47212 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GalP47212 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GalP47212 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GalP47212 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GalP47212 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GalP47212 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GalP47212 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GalP47212 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GalP47212 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GalP47212 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GalP47212 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GalP47212 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GalP47212 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GalP47212 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GalP47212 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GalP47212 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GalP47212 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GalP47212 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GalP47212 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GalP47212 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GalP47212 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GalP47212 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GalP47212 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GalP47212 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GalP47212 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GalP47212 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GalP47212 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GalP47212 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GalP47212 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GalP47212 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GalP47212 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GalP47212 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GalP47212 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GalP47212 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GalP47212 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GalP47212 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GalP47212 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GalP47212 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GalP47212 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GalP47212 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GalP47212 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GalP47212 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GalP47212 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GalP47212 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GalP47212 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GalP47212 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GalP47212 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GalP47212 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GalP47212 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GalP47212 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GalP47212 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GalP47212 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GalP47212 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GalP47212 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GalP47212 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GalP47212 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GalP47212 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GalP47212 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GalP47212 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GalP47212 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GalP47212 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GalP47212 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GalP47212 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms