Protein–RNA interactions for Protein: P47076

RPC17, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, yeastyeast

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC17P47076 SPS1YDR523C 1473 nt7.75□□□□□ -1.17
RPC17P47076 PPZ2YDR436W 2133 nt7.75□□□□□ -1.17
RPC17P47076 BAP3YDR046C 1815 nt7.75□□□□□ -1.17
RPC17P47076 TOD6YBL054W 1578 nt7.75□□□□□ -1.17
RPC17P47076 PSA1YDL055C 1086 nt7.74□□□□□ -1.17
RPC17P47076 YKL147CYKL147C 618 nt7.74□□□□□ -1.17
RPC17P47076 YPT10YBR264C 600 nt7.74□□□□□ -1.17
RPC17P47076 AFG3YER017C 2286 nt7.74□□□□□ -1.17
RPC17P47076 GDH1YOR375C 1365 nt7.73□□□□□ -1.17
RPC17P47076 HAC1YFL031W 717 nt7.73□□□□□ -1.17
RPC17P47076 LIP5YOR196C 1245 nt7.72□□□□□ -1.17
RPC17P47076 NUP53YMR153W 1428 nt7.71□□□□□ -1.17
RPC17P47076 GGC1YDL198C 903 nt7.71□□□□□ -1.18
RPC17P47076 ERV2YPR037C 591 nt7.71□□□□□ -1.18
RPC17P47076 DSC3YOR223W 879 nt7.7□□□□□ -1.18
RPC17P47076 ENB1YOL158C 1821 nt7.69□□□□□ -1.18
RPC17P47076 STS1YIR011C 960 nt7.69□□□□□ -1.18
RPC17P47076 YOR343CYOR343C 327 nt7.69□□□□□ -1.18
RPC17P47076 FCY2YER056C 1602 nt7.69□□□□□ -1.18
RPC17P47076 BNA3YJL060W 1335 nt7.69□□□□□ -1.18
RPC17P47076 GRH1YDR517W 1119 nt7.68□□□□□ -1.18
RPC17P47076 HRA1HRA1 564 nt7.68□□□□□ -1.18
RPC17P47076 RTG2YGL252C 1767 nt7.68□□□□□ -1.18
RPC17P47076 MRP1YDR347W 966 nt7.67□□□□□ -1.18
RPC17P47076 ADE1YAR015W 921 nt7.67□□□□□ -1.18
RPC17P47076 PAU21YOR394W 495 nt7.66□□□□□ -1.18
RPC17P47076 PAU22YPL282C 495 nt7.66□□□□□ -1.18
RPC17P47076 OSM1YJR051W 1506 nt7.66□□□□□ -1.18
RPC17P47076 NUP57YGR119C 1626 nt7.66□□□□□ -1.18
RPC17P47076 SKP1YDR328C 585 nt7.65□□□□□ -1.18
RPC17P47076 FRT1YOR324C 1809 nt7.65□□□□□ -1.18
RPC17P47076 LOT6YLR011W 576 nt7.64□□□□□ -1.19
RPC17P47076 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.64□□□□□ -1.19
RPC17P47076 YLR173WYLR173W 1827 nt7.64□□□□□ -1.19
RPC17P47076 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.63□□□□□ -1.19
RPC17P47076 YJR142WYJR142W 1029 nt7.63□□□□□ -1.19
RPC17P47076 RDR1YOR380W 1641 nt7.62□□□□□ -1.19
RPC17P47076 PMA2YPL036W 2844 nt7.62□□□□□ -1.19
RPC17P47076 CRN1YLR429W 1956 nt7.62□□□□□ -1.19
RPC17P47076 EXG2YDR261C 1689 nt7.61□□□□□ -1.19
RPC17P47076 HRB1YNL004W 1365 nt7.6□□□□□ -1.19
RPC17P47076 YDR476CYDR476C 675 nt7.6□□□□□ -1.19
RPC17P47076 RFS1YBR052C 633 nt7.6□□□□□ -1.19
RPC17P47076 GNP1YDR508C 1992 nt7.59□□□□□ -1.19
RPC17P47076 CDC7YDL017W 1524 nt7.59□□□□□ -1.19
RPC17P47076 YCR041WYCR041W 333 nt7.59□□□□□ -1.19
RPC17P47076 SNF4YGL115W 969 nt7.59□□□□□ -1.19
RPC17P47076 YJL213WYJL213W 996 nt7.59□□□□□ -1.19
RPC17P47076 ATO2YNR002C 849 nt7.59□□□□□ -1.19
RPC17P47076 CDC3YLR314C 1563 nt7.59□□□□□ -1.2
RPC17P47076 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.58□□□□□ -1.2
RPC17P47076 CCW12YLR110C 402 nt7.58□□□□□ -1.2
RPC17P47076 YMR074CYMR074C 438 nt7.58□□□□□ -1.2
RPC17P47076 CTF3YLR381W 2202 nt7.58□□□□□ -1.2
RPC17P47076 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.57□□□□□ -1.2
RPC17P47076 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.57□□□□□ -1.2
RPC17P47076 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.57□□□□□ -1.2
RPC17P47076 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.57□□□□□ -1.2
RPC17P47076 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.57□□□□□ -1.2
RPC17P47076 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.57□□□□□ -1.2
RPC17P47076 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.57□□□□□ -1.2
RPC17P47076 NMA2YGR010W 1188 nt7.57□□□□□ -1.2
RPC17P47076 PIL1YGR086C 1020 nt7.57□□□□□ -1.2
RPC17P47076 NCA3YJL116C 1014 nt7.57□□□□□ -1.2
RPC17P47076 YDR306CYDR306C 1437 nt7.57□□□□□ -1.2
RPC17P47076 TOS1YBR162C 1368 nt7.57□□□□□ -1.2
RPC17P47076 GCD11YER025W 1584 nt7.56□□□□□ -1.2
RPC17P47076 YLR112WYLR112W 420 nt7.56□□□□□ -1.2
RPC17P47076 YOR012WYOR012W 414 nt7.56□□□□□ -1.2
RPC17P47076 MSI1YBR195C 1269 nt7.56□□□□□ -1.2
RPC17P47076 MHP1YJL042W 4197 nt7.55□□□□□ -1.2
RPC17P47076 PGI1YBR196C 1665 nt7.55□□□□□ -1.2
RPC17P47076 YGL081WYGL081W 963 nt7.55□□□□□ -1.2
RPC17P47076 AIM2YAL049C 741 nt7.55□□□□□ -1.2
RPC17P47076 SUN4YNL066W 1263 nt7.54□□□□□ -1.2
RPC17P47076 YOR268CYOR268C 399 nt7.54□□□□□ -1.2
RPC17P47076 PET117YER058W 324 nt7.52□□□□□ -1.21
RPC17P47076 FUS3YBL016W 1062 nt7.52□□□□□ -1.21
RPC17P47076 ECM10YEL030W 1935 nt7.52□□□□□ -1.21
RPC17P47076 PHO85YPL031C 918 nt7.51□□□□□ -1.21
RPC17P47076 RPL43AYPR043W 279 nt7.51□□□□□ -1.21
RPC17P47076 NUP84YDL116W 2181 nt7.51□□□□□ -1.21
RPC17P47076 CIT2YCR005C 1383 nt7.5□□□□□ -1.21
RPC17P47076 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.5□□□□□ -1.21
RPC17P47076 SDH8YBR269C 417 nt7.5□□□□□ -1.21
RPC17P47076 MAS2YHR024C 1449 nt7.5□□□□□ -1.21
RPC17P47076 PAC10YGR078C 600 nt7.49□□□□□ -1.21
RPC17P47076 ERG27YLR100W 1044 nt7.49□□□□□ -1.21
RPC17P47076 YPR127WYPR127W 1038 nt7.49□□□□□ -1.21
RPC17P47076 PAM17YKR065C 594 nt7.48□□□□□ -1.21
RPC17P47076 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.47□□□□□ -1.21
RPC17P47076 DOC1YGL240W 753 nt7.46□□□□□ -1.22
RPC17P47076 PET494YNR045W 1470 nt7.46□□□□□ -1.22
RPC17P47076 NDE1YMR145C 1683 nt7.46□□□□□ -1.22
RPC17P47076 MFG1YDL233W 1377 nt7.46□□□□□ -1.22
RPC17P47076 TDP1YBR223C 1635 nt7.45□□□□□ -1.22
RPC17P47076 EDC2YER035W 438 nt7.45□□□□□ -1.22
RPC17P47076 DMC1YER179W 1005 nt7.45□□□□□ -1.22
RPC17P47076 YML122CYML122C 381 nt7.45□□□□□ -1.22
RPC17P47076 SNT309YPR101W 528 nt7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 66.1 ms