Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Nedd4P46935 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nedd4P46935 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nedd4P46935 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nedd4P46935 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nedd4P46935 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nedd4P46935 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nedd4P46935 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nedd4P46935 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nedd4P46935 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nedd4P46935 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nedd4P46935 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nedd4P46935 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nedd4P46935 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nedd4P46935 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nedd4P46935 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nedd4P46935 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.1 ms