Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zic1P46684 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zic1P46684 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zic1P46684 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic1P46684 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zic1P46684 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic1P46684 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic1P46684 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zic1P46684 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic1P46684 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic1P46684 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic1P46684 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zic1P46684 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zic1P46684 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zic1P46684 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zic1P46684 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zic1P46684 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms