Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps4bP46467 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps4bP46467 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps4bP46467 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps4bP46467 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms