Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSFMP43897 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSFMP43897 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSFMP43897 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSFMP43897 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSFMP43897 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSFMP43897 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSFMP43897 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSFMP43897 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSFMP43897 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSFMP43897 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSFMP43897 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSFMP43897 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TSFMP43897 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSFMP43897 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSFMP43897 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSFMP43897 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSFMP43897 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSFMP43897 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSFMP43897 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSFMP43897 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSFMP43897 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSFMP43897 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSFMP43897 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSFMP43897 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSFMP43897 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSFMP43897 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSFMP43897 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSFMP43897 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSFMP43897 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSFMP43897 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSFMP43897 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSFMP43897 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSFMP43897 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSFMP43897 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSFMP43897 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSFMP43897 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSFMP43897 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSFMP43897 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSFMP43897 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSFMP43897 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSFMP43897 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSFMP43897 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSFMP43897 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSFMP43897 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSFMP43897 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSFMP43897 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSFMP43897 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TSFMP43897 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSFMP43897 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSFMP43897 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSFMP43897 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSFMP43897 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSFMP43897 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSFMP43897 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSFMP43897 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSFMP43897 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSFMP43897 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSFMP43897 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSFMP43897 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSFMP43897 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSFMP43897 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSFMP43897 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSFMP43897 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSFMP43897 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSFMP43897 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSFMP43897 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSFMP43897 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSFMP43897 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSFMP43897 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSFMP43897 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSFMP43897 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSFMP43897 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSFMP43897 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSFMP43897 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSFMP43897 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSFMP43897 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSFMP43897 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSFMP43897 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSFMP43897 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSFMP43897 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSFMP43897 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSFMP43897 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSFMP43897 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSFMP43897 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSFMP43897 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSFMP43897 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSFMP43897 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSFMP43897 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSFMP43897 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSFMP43897 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSFMP43897 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSFMP43897 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSFMP43897 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSFMP43897 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSFMP43897 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSFMP43897 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSFMP43897 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSFMP43897 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TSFMP43897 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms