Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh2P43247 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh2P43247 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msh2P43247 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh2P43247 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msh2P43247 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Msh2P43247 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msh2P43247 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh2P43247 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msh2P43247 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Msh2P43247 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh2P43247 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh2P43247 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh2P43247 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh2P43247 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms