Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC45.96■■■■■ 4.95
NCAPD3P42695 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
NCAPD3P42695 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
NCAPD3P42695 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
NCAPD3P42695 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
NCAPD3P42695 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
NCAPD3P42695 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC45.93■■■■■ 4.94
NCAPD3P42695 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
NCAPD3P42695 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
NCAPD3P42695 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
NCAPD3P42695 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC45.9■■■■■ 4.94
NCAPD3P42695 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.89■■■■■ 4.94
NCAPD3P42695 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
NCAPD3P42695 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.93
NCAPD3P42695 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.87■■■■■ 4.93
NCAPD3P42695 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
NCAPD3P42695 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC45.86■■■■■ 4.93
NCAPD3P42695 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC45.86■■■■■ 4.93
NCAPD3P42695 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
NCAPD3P42695 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
NCAPD3P42695 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
NCAPD3P42695 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
NCAPD3P42695 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
NCAPD3P42695 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
NCAPD3P42695 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
NCAPD3P42695 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC45.81■■■■■ 4.92
NCAPD3P42695 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
NCAPD3P42695 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
NCAPD3P42695 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
NCAPD3P42695 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
NCAPD3P42695 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
NCAPD3P42695 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
NCAPD3P42695 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC45.78■■■■■ 4.92
NCAPD3P42695 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
NCAPD3P42695 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
NCAPD3P42695 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC45.76■■■■■ 4.92
NCAPD3P42695 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.73■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
NCAPD3P42695 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.69■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC45.66■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.65■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC45.63■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
NCAPD3P42695 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
NCAPD3P42695 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
NCAPD3P42695 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
NCAPD3P42695 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
NCAPD3P42695 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
NCAPD3P42695 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
NCAPD3P42695 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC45.61■■■■■ 4.89
NCAPD3P42695 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
NCAPD3P42695 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
NCAPD3P42695 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
NCAPD3P42695 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC45.59■■■■■ 4.89
NCAPD3P42695 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
NCAPD3P42695 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
NCAPD3P42695 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC45.57■■■■■ 4.89
NCAPD3P42695 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
NCAPD3P42695 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
NCAPD3P42695 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
NCAPD3P42695 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
NCAPD3P42695 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
NCAPD3P42695 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms