Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TMPOP42166 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TMPOP42166 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TMPOP42166 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TMPOP42166 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TMPOP42166 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TMPOP42166 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TMPOP42166 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TMPOP42166 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
TMPOP42166 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TMPOP42166 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TMPOP42166 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TMPOP42166 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TMPOP42166 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMPOP42166 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMPOP42166 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMPOP42166 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMPOP42166 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMPOP42166 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMPOP42166 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TMPOP42166 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TMPOP42166 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TMPOP42166 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
TMPOP42166 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TMPOP42166 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TMPOP42166 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TMPOP42166 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMPOP42166 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMPOP42166 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMPOP42166 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMPOP42166 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMPOP42166 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMPOP42166 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMPOP42166 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMPOP42166 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMPOP42166 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMPOP42166 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMPOP42166 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TMPOP42166 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TMPOP42166 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TMPOP42166 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMPOP42166 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
TMPOP42166 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMPOP42166 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMPOP42166 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TMPOP42166 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TMPOP42166 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TMPOP42166 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TMPOP42166 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TMPOP42166 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TMPOP42166 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TMPOP42166 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TMPOP42166 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TMPOP42166 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TMPOP42166 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TMPOP42166 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TMPOP42166 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TMPOP42166 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TMPOP42166 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TMPOP42166 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TMPOP42166 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TMPOP42166 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TMPOP42166 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TMPOP42166 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMPOP42166 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMPOP42166 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMPOP42166 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TMPOP42166 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TMPOP42166 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TMPOP42166 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TMPOP42166 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TMPOP42166 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TMPOP42166 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TMPOP42166 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TMPOP42166 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TMPOP42166 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TMPOP42166 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TMPOP42166 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TMPOP42166 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TMPOP42166 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TMPOP42166 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TMPOP42166 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TMPOP42166 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TMPOP42166 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TMPOP42166 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TMPOP42166 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TMPOP42166 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TMPOP42166 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TMPOP42166 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMPOP42166 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMPOP42166 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMPOP42166 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMPOP42166 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMPOP42166 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMPOP42166 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMPOP42166 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TMPOP42166 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TMPOP42166 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TMPOP42166 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TMPOP42166 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms