Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TfamP40630 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TfamP40630 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TfamP40630 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TfamP40630 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TfamP40630 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TfamP40630 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TfamP40630 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TfamP40630 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TfamP40630 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TfamP40630 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TfamP40630 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TfamP40630 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TfamP40630 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TfamP40630 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TfamP40630 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TfamP40630 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TfamP40630 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TfamP40630 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TfamP40630 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TfamP40630 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TfamP40630 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TfamP40630 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TfamP40630 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TfamP40630 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TfamP40630 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TfamP40630 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TfamP40630 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TfamP40630 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TfamP40630 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TfamP40630 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TfamP40630 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TfamP40630 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TfamP40630 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TfamP40630 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TfamP40630 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TfamP40630 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TfamP40630 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TfamP40630 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TfamP40630 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TfamP40630 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TfamP40630 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TfamP40630 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TfamP40630 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TfamP40630 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TfamP40630 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TfamP40630 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TfamP40630 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TfamP40630 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TfamP40630 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TfamP40630 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TfamP40630 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TfamP40630 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TfamP40630 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TfamP40630 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TfamP40630 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TfamP40630 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TfamP40630 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TfamP40630 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TfamP40630 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TfamP40630 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TfamP40630 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TfamP40630 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TfamP40630 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TfamP40630 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TfamP40630 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TfamP40630 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TfamP40630 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TfamP40630 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TfamP40630 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TfamP40630 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TfamP40630 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TfamP40630 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TfamP40630 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TfamP40630 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TfamP40630 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TfamP40630 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TfamP40630 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TfamP40630 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TfamP40630 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TfamP40630 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TfamP40630 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TfamP40630 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TfamP40630 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TfamP40630 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TfamP40630 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TfamP40630 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TfamP40630 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TfamP40630 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TfamP40630 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TfamP40630 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TfamP40630 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TfamP40630 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TfamP40630 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
TfamP40630 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TfamP40630 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TfamP40630 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TfamP40630 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TfamP40630 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TfamP40630 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms