Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Chd1P40201 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Chd1P40201 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Chd1P40201 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Chd1P40201 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Chd1P40201 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Chd1P40201 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Chd1P40201 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Chd1P40201 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Chd1P40201 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Chd1P40201 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Chd1P40201 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Chd1P40201 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Chd1P40201 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Chd1P40201 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Chd1P40201 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Chd1P40201 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Chd1P40201 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Chd1P40201 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Chd1P40201 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Chd1P40201 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Chd1P40201 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Chd1P40201 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Chd1P40201 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Chd1P40201 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Chd1P40201 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Chd1P40201 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Chd1P40201 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Chd1P40201 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Chd1P40201 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Chd1P40201 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Chd1P40201 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Chd1P40201 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Chd1P40201 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Chd1P40201 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Chd1P40201 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Chd1P40201 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Chd1P40201 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Chd1P40201 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Chd1P40201 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Chd1P40201 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Chd1P40201 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Chd1P40201 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Chd1P40201 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Chd1P40201 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Chd1P40201 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Chd1P40201 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Chd1P40201 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Chd1P40201 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Chd1P40201 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Chd1P40201 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Chd1P40201 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Chd1P40201 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Chd1P40201 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Chd1P40201 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Chd1P40201 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Chd1P40201 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Chd1P40201 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Chd1P40201 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Chd1P40201 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Chd1P40201 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Chd1P40201 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Chd1P40201 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Chd1P40201 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Chd1P40201 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Chd1P40201 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Chd1P40201 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Chd1P40201 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Chd1P40201 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Chd1P40201 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Chd1P40201 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Chd1P40201 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Chd1P40201 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Chd1P40201 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Chd1P40201 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Chd1P40201 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Chd1P40201 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Chd1P40201 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Chd1P40201 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Chd1P40201 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Chd1P40201 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Chd1P40201 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Chd1P40201 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Chd1P40201 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Chd1P40201 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Chd1P40201 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Chd1P40201 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Chd1P40201 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Chd1P40201 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Chd1P40201 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Chd1P40201 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Chd1P40201 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Chd1P40201 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Chd1P40201 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Chd1P40201 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Chd1P40201 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Chd1P40201 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Chd1P40201 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Chd1P40201 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Chd1P40201 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms