Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPGP40121 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPGP40121 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPGP40121 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPGP40121 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPGP40121 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPGP40121 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPGP40121 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPGP40121 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPGP40121 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPGP40121 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPGP40121 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPGP40121 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPGP40121 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPGP40121 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPGP40121 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPGP40121 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPGP40121 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPGP40121 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPGP40121 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPGP40121 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPGP40121 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPGP40121 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPGP40121 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPGP40121 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPGP40121 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPGP40121 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPGP40121 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPGP40121 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPGP40121 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPGP40121 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPGP40121 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPGP40121 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPGP40121 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPGP40121 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPGP40121 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPGP40121 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPGP40121 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPGP40121 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPGP40121 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPGP40121 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPGP40121 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPGP40121 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPGP40121 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPGP40121 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPGP40121 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPGP40121 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPGP40121 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPGP40121 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPGP40121 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPGP40121 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPGP40121 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPGP40121 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPGP40121 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPGP40121 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPGP40121 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPGP40121 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPGP40121 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPGP40121 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPGP40121 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPGP40121 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPGP40121 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPGP40121 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPGP40121 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPGP40121 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPGP40121 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPGP40121 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPGP40121 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPGP40121 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPGP40121 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPGP40121 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPGP40121 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPGP40121 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPGP40121 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPGP40121 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPGP40121 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPGP40121 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPGP40121 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPGP40121 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPGP40121 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPGP40121 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPGP40121 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPGP40121 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPGP40121 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPGP40121 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPGP40121 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPGP40121 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPGP40121 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPGP40121 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CAPGP40121 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPGP40121 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPGP40121 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPGP40121 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPGP40121 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPGP40121 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPGP40121 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPGP40121 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPGP40121 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPGP40121 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPGP40121 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms