Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timp3P39876 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timp3P39876 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timp3P39876 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timp3P39876 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timp3P39876 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timp3P39876 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timp3P39876 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timp3P39876 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timp3P39876 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timp3P39876 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Timp3P39876 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Timp3P39876 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms