Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 YCR041WYCR041W 333 nt6.29□□□□□ -1.4
AVT5P38176 HMS2YJR147W 1077 nt6.29□□□□□ -1.4
AVT5P38176 SEN2YLR105C 1134 nt6.29□□□□□ -1.4
AVT5P38176 RHO1YPR165W 630 nt6.29□□□□□ -1.4
AVT5P38176 GTT3YEL017W 1014 nt6.28□□□□□ -1.4
AVT5P38176 PUP3YER094C 618 nt6.28□□□□□ -1.4
AVT5P38176 CAK1YFL029C 1107 nt6.28□□□□□ -1.4
AVT5P38176 YGR210CYGR210C 1236 nt6.28□□□□□ -1.4
AVT5P38176 RRT14YIL127C 621 nt6.28□□□□□ -1.4
AVT5P38176 TPK1YJL164C 1194 nt6.28□□□□□ -1.4
AVT5P38176 LOT6YLR011W 576 nt6.28□□□□□ -1.4
AVT5P38176 ADE17YMR120C 1779 nt6.28□□□□□ -1.4
AVT5P38176 NOG2YNR053C 1461 nt6.28□□□□□ -1.4
AVT5P38176 FPR2YDR519W 408 nt6.27□□□□□ -1.41
AVT5P38176 YJL064WYJL064W 396 nt6.27□□□□□ -1.41
AVT5P38176 MSS51YLR203C 1311 nt6.26□□□□□ -1.41
AVT5P38176 YPT31YER031C 672 nt6.26□□□□□ -1.41
AVT5P38176 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt6.26□□□□□ -1.41
AVT5P38176 YHR131CYHR131C 2553 nt6.26□□□□□ -1.41
AVT5P38176 TPI1YDR050C 747 nt6.25□□□□□ -1.41
AVT5P38176 NAP1YKR048C 1254 nt6.25□□□□□ -1.41
AVT5P38176 YPL108WYPL108W 507 nt6.25□□□□□ -1.41
AVT5P38176 THI73YLR004C 1572 nt6.25□□□□□ -1.41
AVT5P38176 TCB1YOR086C 3561 nt6.24□□□□□ -1.41
AVT5P38176 HNM1YGL077C 1692 nt6.24□□□□□ -1.41
AVT5P38176 PAU19YMR325W 375 nt6.24□□□□□ -1.41
AVT5P38176 LSP1YPL004C 1026 nt6.24□□□□□ -1.41
AVT5P38176 FCY2YER056C 1602 nt6.24□□□□□ -1.41
AVT5P38176 YLR112WYLR112W 420 nt6.23□□□□□ -1.41
AVT5P38176 SHC1YER096W 1539 nt6.23□□□□□ -1.41
AVT5P38176 HXT8YJL214W 1710 nt6.22□□□□□ -1.41
AVT5P38176 PRY2YKR013W 990 nt6.22□□□□□ -1.41
AVT5P38176 CTF8YHR191C 402 nt6.21□□□□□ -1.42
AVT5P38176 PRE10YOR362C 867 nt6.21□□□□□ -1.42
AVT5P38176 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.2□□□□□ -1.42
AVT5P38176 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.2□□□□□ -1.42
AVT5P38176 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.2□□□□□ -1.42
AVT5P38176 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.2□□□□□ -1.42
AVT5P38176 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.2□□□□□ -1.42
AVT5P38176 SNP1YIL061C 903 nt6.2□□□□□ -1.42
AVT5P38176 PMU1YKL128C 888 nt6.2□□□□□ -1.42
AVT5P38176 YPL041CYPL041C 624 nt6.2□□□□□ -1.42
AVT5P38176 CYB2YML054C 1776 nt6.2□□□□□ -1.42
AVT5P38176 CRN1YLR429W 1956 nt6.2□□□□□ -1.42
AVT5P38176 TKL2YBR117C 2046 nt6.2□□□□□ -1.42
AVT5P38176 VBA5YKR105C 1749 nt6.19□□□□□ -1.42
AVT5P38176 TIM50YPL063W 1431 nt6.19□□□□□ -1.42
AVT5P38176 NTG1YAL015C 1200 nt6.19□□□□□ -1.42
AVT5P38176 FCY1YPR062W 477 nt6.18□□□□□ -1.42
AVT5P38176 NMD5YJR132W 3147 nt6.18□□□□□ -1.42
AVT5P38176 CDC3YLR314C 1563 nt6.18□□□□□ -1.42
AVT5P38176 NUP57YGR119C 1626 nt6.17□□□□□ -1.42
AVT5P38176 VPS65YLR322W 315 nt6.17□□□□□ -1.42
AVT5P38176 ECM27YJR106W 2178 nt6.17□□□□□ -1.42
AVT5P38176 YPR084WYPR084W 1371 nt6.17□□□□□ -1.42
AVT5P38176 GLN3YER040W 2193 nt6.16□□□□□ -1.42
AVT5P38176 YCP4YCR004C 744 nt6.16□□□□□ -1.42
AVT5P38176 RTC2YBR147W 891 nt6.16□□□□□ -1.42
AVT5P38176 ECM38YLR299W 1983 nt6.16□□□□□ -1.42
AVT5P38176 RPL2BYIL018W 765 nt6.15□□□□□ -1.42
AVT5P38176 YMR206WYMR206W 942 nt6.15□□□□□ -1.42
AVT5P38176 ARC35YNR035C 1029 nt6.15□□□□□ -1.42
AVT5P38176 ARG7YMR062C 1326 nt6.15□□□□□ -1.43
AVT5P38176 FCY22YER060W-A 1593 nt6.14□□□□□ -1.43
AVT5P38176 YER156CYER156C 1017 nt6.14□□□□□ -1.43
AVT5P38176 HAM1YJR069C 594 nt6.14□□□□□ -1.43
AVT5P38176 JHD1YER051W 1479 nt6.14□□□□□ -1.43
AVT5P38176 YLL066CYLL066C 3618 nt6.13□□□□□ -1.43
AVT5P38176 SWM1YDR260C 513 nt6.13□□□□□ -1.43
AVT5P38176 SNF7YLR025W 723 nt6.13□□□□□ -1.43
AVT5P38176 YMR007WYMR007W 381 nt6.13□□□□□ -1.43
AVT5P38176 BXI1YNL305C 894 nt6.13□□□□□ -1.43
AVT5P38176 MNN9YPL050C 1188 nt6.13□□□□□ -1.43
AVT5P38176 OPI11YPR044C 354 nt6.13□□□□□ -1.43
AVT5P38176 EXG2YDR261C 1689 nt6.13□□□□□ -1.43
AVT5P38176 AFG3YER017C 2286 nt6.13□□□□□ -1.43
AVT5P38176 AOS1YPR180W 1044 nt6.12□□□□□ -1.43
AVT5P38176 TOS1YBR162C 1368 nt6.12□□□□□ -1.43
AVT5P38176 MCH2YKL221W 1422 nt6.11□□□□□ -1.43
AVT5P38176 RCR1YBR005W 642 nt6.11□□□□□ -1.43
AVT5P38176 YBR241CYBR241C 1467 nt6.1□□□□□ -1.43
AVT5P38176 BDF2YDL070W 1917 nt6.1□□□□□ -1.43
AVT5P38176 HSP12YFL014W 330 nt6.1□□□□□ -1.43
AVT5P38176 MTR3YGR158C 753 nt6.1□□□□□ -1.43
AVT5P38176 YJL160CYJL160C 864 nt6.1□□□□□ -1.43
AVT5P38176 YNL200CYNL200C 741 nt6.1□□□□□ -1.43
AVT5P38176 PAU21YOR394W 495 nt6.1□□□□□ -1.43
AVT5P38176 RPS6AYPL090C 711 nt6.1□□□□□ -1.43
AVT5P38176 PAU22YPL282C 495 nt6.1□□□□□ -1.43
AVT5P38176 RPS6BYBR181C 711 nt6.1□□□□□ -1.43
AVT5P38176 HXT2YMR011W 1626 nt6.1□□□□□ -1.43
AVT5P38176 ATP2YJR121W 1536 nt6.09□□□□□ -1.43
AVT5P38176 PET18YCR020C 648 nt6.09□□□□□ -1.43
AVT5P38176 QCR6YFR033C 444 nt6.09□□□□□ -1.43
AVT5P38176 YAL045CYAL045C 309 nt6.09□□□□□ -1.43
AVT5P38176 PET10YKR046C 852 nt6.09□□□□□ -1.43
AVT5P38176 MFT1YML062C 1179 nt6.09□□□□□ -1.43
AVT5P38176 PUP1YOR157C 786 nt6.09□□□□□ -1.43
AVT5P38176 LIP5YOR196C 1245 nt6.09□□□□□ -1.43
AVT5P38176 NUP84YDL116W 2181 nt6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25 ms