Protein–RNA interactions for Protein: P35951

Ldlr, Low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdlrP35951 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LdlrP35951 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LdlrP35951 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LdlrP35951 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LdlrP35951 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LdlrP35951 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LdlrP35951 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LdlrP35951 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LdlrP35951 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LdlrP35951 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LdlrP35951 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LdlrP35951 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LdlrP35951 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LdlrP35951 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LdlrP35951 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LdlrP35951 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LdlrP35951 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LdlrP35951 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LdlrP35951 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LdlrP35951 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LdlrP35951 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LdlrP35951 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LdlrP35951 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LdlrP35951 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LdlrP35951 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LdlrP35951 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LdlrP35951 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LdlrP35951 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LdlrP35951 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LdlrP35951 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LdlrP35951 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms